Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxb1P17919 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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