Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms