Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms