Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp1P11438 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lamp1P11438 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lamp1P11438 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lamp1P11438 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp1P11438 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp1P11438 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp1P11438 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp1P11438 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp1P11438 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp1P11438 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp1P11438 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms