Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms