Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PolP10400 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PolP10400 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PolP10400 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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