Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms