Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itgb1P09055 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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