Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spta1P08032 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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