Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-T23P06339 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms