Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ifnb1P01575 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms