Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ptpn20O55082 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ptpn20O55082 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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