Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjd2O54851 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms