Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sdc4O35988 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sdc4O35988 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sdc4O35988 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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