Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms