Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Casq1O09165 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms