Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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PrkcshO08795 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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PrkcshO08795 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcshO08795 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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