Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efna5O08543 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efna5O08543 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms