Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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