Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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