Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gm21060J3KMU4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21060J3KMU4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms