Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21818J3KMS6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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