Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm17535J3KMR8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm17535J3KMR8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm17535J3KMR8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm17535J3KMR8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm17535J3KMR8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm17535J3KMR8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm17535J3KMR8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm17535J3KMR8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17535J3KMR8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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