Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Taf4bG5E8Z2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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