Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34aG3UW52 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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