Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Farp1F8VPU2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Farp1F8VPU2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms