Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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H2-M1F7CXU4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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