Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngap1F6SEU4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms