Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx60E9PZQ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms