Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Sfta2E9PXB6 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms