Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc17E9PVB5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms