Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms