Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde2E9PUP1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms