Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3bE9PUL3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms