Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clip3B9EHT4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clip3B9EHT4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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