Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms