Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms