Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf3B2RUQ2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms