Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Palm3A2TJV2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palm3A2TJV2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palm3A2TJV2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palm3A2TJV2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palm3A2TJV2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palm3A2TJV2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palm3A2TJV2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Palm3A2TJV2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palm3A2TJV2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms