Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GabreA2AMW3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms