Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms