Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CcniQ9Z2V9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms