Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp5Q9Z2P8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms