Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn7Q9Z261 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms