Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn8Q9Z260 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cldn8Q9Z260 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Cldn8Q9Z260 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Cldn8Q9Z260 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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