Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap3b1Q9Z1T1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap3b1Q9Z1T1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms