Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lgr5Q9Z1P4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms