Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sumo3Q9Z172 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Sumo3Q9Z172 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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Sumo3Q9Z172 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Sumo3Q9Z172 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Sumo3Q9Z172 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Sumo3Q9Z172 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Sumo3Q9Z172 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Sumo3Q9Z172 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Sumo3Q9Z172 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Sumo3Q9Z172 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sumo3Q9Z172 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms