Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb3Q9R1P1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms