Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Plod1Q9R0E2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod1Q9R0E2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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